Il motivo per cui è diverso non è mai realmente dichiarato, ma possiamo dedurne il motivo.
Innanzitutto, ci sono tre occhi diversi in Naruto. Dal più debole al più forte, sono Byakugan, Sharingan e Rinnegan. Quindi il byakugan rimarrà un byakugan per sempre, ma può trasformarsi in un Tensaigan (non ricordo come, ma non importa). Ora per i più importanti Rinnegan e Sharingan, Sharingan può evolvere in Rinnegan. Tuttavia, prima di questo, ci sono 3 cose necessarie: uno Sharingan completamente sviluppato, 3 Tomoe Mangekyou, poi eterno.
Quindi, per quanto riguarda ciò che è il Rinnegan, è fondamentalmente un misto di uno Sharingan e dei suoi tratti propri, ma l'aspetto Sharingan è utilizzabile solo per Uchihas. Ecco perché Nagato non può usare gli effetti di Sharingan, ma Sasuke e Madara sì.
Ora, per il motivo per cui l'aspetto di Sasuke è diverso, Madara ha preso il chakra Senju di Hashirama e lo ha combinato con il suo, il che ha fatto evolvere lo Sharingan, che è una sorta di unico modo per far evolvere uno Sharingan, e Sasuke fa qualcosa di simile, tranne che il saggio del sesto percorso dà a Sasuke metà del suo chakra, che è molto più di quello di Hashirama. Così, i suoi occhi sembrano quasi trasformarsi in una Rinne Sharingan. Inoltre, la ragione per cui le loro abilità sono diverse è che è proprio così che funzionano i Rinnegan come i Mangekyou Sharingan fanno la stessa cosa